Климат-контроль опирается при регулировке заслонок и скорости вентилятора на датчик салонной температуры, забортной температуры и ещё на ряд показаний.
Я бы в первую очередь (раз сам кондиционер вроде как исправен) смотрел салонный датчик температуры, забортный датчик температуры (его показания можно на бортовом компе глянуть - они должны соответствовать погоде) и блок управления климатом (разъемы, повреждения проводки и т.д.). Могли при установке мультимедии/подогрева сидений/чего-либо ещё повредить проводку или сдёрнуть какой-нибудь разъём.